武器系统则是可以收集各种各样的经典武器，不再像以前一样单一的武器了。每收集到新的武器都会放入武器背包里，在武器图鉴里还能激活该武器为你的人物增加永久属性。每种武器都带有各自特殊的被动技能，比如突击步枪自带近身战用的匕首，机关枪能大幅度提高射速，狙击枪带有强力的穿透效果。能更好的进行战斗。

装备系统随等级开启激活，只增加人物的防御和生命。装备强化系统跟武器强化0系统类似，不过只有一种强化方式，每强化满10级必须突破一次然后才能再次强化，突破需要的材料必须在剧情模式里的精英关卡才能取得。这样可以让玩家一步步打造出属于自己的神器。

丰富的模式及关卡设计

除了最基础的剧情模式以外，《魂斗罗：归来》还为我们提供了丰富的额外PVE模式，它们是挑战模式、组队冒险、试炼模式。挑战模式分为无尽模式、BOSS挑战、悬赏模式、生存模式。无尽模式是将剧情模式里的敌人和BOSS放到一张只一屏的小地图里进行挑战的设置，一共有100关，每5关有1次宝箱奖励，这大大的提高了玩家的闯关兴趣。

组队冒险则是类似于其他游戏的组队副本，最少必须2个人组队才能参加。试炼模式则是分为活动模式和军械大师，目前小编等级不够还没有解锁军械大师。活动模式则分为金币挑战、经验挑战、超武挑战，各自产出不同的资源。

最大特色魂斗罗PVP模式

这次魂斗罗手游最大的创新就是首次加入了PVP的模式。这完全是单机没有的，而他的PVP模式总的分竞技和擂台2种模式。竞技模式是需要玩家操作的PVP模式，分为竞技场和排位赛，竞技场又分为个人竞技(1V1)、据点占领(3V3)、团队竞技(3V3)，而排位赛目前只支持1V1。擂台模式就很浅显易懂了，是自动战斗的，类似其他游戏的竞技场模式，你需要将战力低于你的人击败然后一直往上爬，排名越高每日的奖励越高。