在积分赛系统中，玩家可以查看自己的排名、积分、段位和小队战力等个人战绩，并可在左侧的积分赛排行榜内查看当前的积分排名和各个小队的出战忍者、小队战力和积分等信息。当然，积分赛排行榜前列的忍者小队搭配，也可以作为你自己出战忍者的组合搭配参考，出战忍者的品质越高，获胜的几率当然也就越大。

积分赛是3v3的比赛，在战斗开始前，你可以在【更换忍者】栏内选择自己的3名出战忍者，并且可自由设定出战顺序，在选定后点击确认即可。系统会根据你的小队战力为你匹配战力相近的几支队伍供你挑战，在这里建议选择战力较低或出战忍者较弱的队伍进行挑战，这样成功的几率会大很多。挑战成功可以获得积分，挑战失败则会扣除一定积分，当积分达到一定数值时就可以进阶段位，每天晚上9点，系统都会根据你当前的段位发放段位奖励，前100名玩家还可获得额外奖励。

在出战忍者的阵容选择方面，尽量远程和近程的忍者兼顾，这样会相对平衡。鉴于平民玩家大多数的忍者都是C级忍者，所以建议可以选择奈良鹿丸、宇智波佐助和山中井野这个组合。其中，奈良鹿丸是远程攻击，虽然攻击速度不快，但是普通技能都有将敌人从远处推向自己的能力，利用好两个普通技能去牵制敌人并给自己创造进攻的机会，是使用鹿丸的核心。宇智波佐助的豪火球的范围很大，牵制或连击都很实用。狮子连弹会向前快速突进一小段距离，非常适合突击或追击使用，且他的大招技能可以重创并击飞目标，也在一定程度上保证了自身的安全。山中井野技能万花缭乱可对范围内的敌人进行连续攻击，并造成目标浮空，心乱身之术也会使目标攻击自己，在一定程度上为队友分担伤害。

在积分赛战斗中，是系统自动战斗。玩家可以在战斗界面开启自动或关闭自动，也就是大招的释放。因为大招是战斗胜利的一个关键因素，所以在挑战时，你可以关闭自动战斗，并自己进行手动大招释放。如果开启自动的话，从挑战开始后每10秒放一次大招，3个忍者的大招CD共享，释放后不能进行其他忍者大招的释放，需等待倒计时结束。关闭自动后，你可以根据场上的战局和忍者的走位，抓住时机释放大招，这样比开启自动大招更容易打出高伤害和控制效果，获胜的概率也就越大。